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परियोजना निदेशालय का उद्देश्य प्रत्येक क्षेत्र के (जैसे पतन और बंदरगाह, अपशिष्ट निपटान) अन्य क्षेत्रों पर होने वाले क्षेत्रीय प्रभावों के मूल्यांकन में जीआईएस, दूर संवेदन, पर्यावरणीय प्रभाव मूल्यांकन तथा गणितीय मॉडलिंग के अनुप्रयोग को प्रदर्शित करना और तटीय समुद्री क्षेत्रों में होने वाली आर्थिक गतिविधियों के सतत् विकास के लिए प्रतिकूल प्रभावों को कम करने तथा संसाधनों को बनाए रखने के लिए एकीकृत प्रबंधन समाधान के विकास के लिए इन उपकरणों का प्रयोग करना है।

मिशन

• महत्वपूर्ण तटीय पैरामीटर प्रक्रियाओं और परिघटना को समझने के लिए महत्वपूर्ण सामाजिक, आर्थिक और पर्यावरणीय लाभ वाली क्षमता का विकास करना और उसमें वृद्धि करना ।
• तटीय क्षेत्रों को इकमाम की संकल्पना के कार्यान्वयन और संसाधनों के सतत् प्रयोग के लिए पारिस्थतिकी-आधारित प्रबंधन के लिए वैज्ञानिक और तकनीकी सहायता उपलब्ध करवाना ।